臺北市藥師公會成立於民國35年6月1日，歷經臺北市升格及藥師法公告實施，民國68年6月30日由「臺北市藥劑師公會」改名為「臺北市藥師公會」。
依章程規定，由會員代表大會選出理事15人，監事5人，候補理事5人，候補 監事 1人，在理事會監督下並組成13個委員會及有關工作小組執行業務工作推動。
在歷任理事長及幹部努力下，在會務運作及管理方面、醫藥分業推動、持續教育、參與民眾用藥安全、反毒、防制藥物濫用、參與國際藥學會議、鼓勵藥師會員 參與基層選舉等提升藥師地位和建立良好執業環境均具成效。
藥師公會為所有藥師會員凝聚力量的團體，棒棒交接，精神傳承服務提升，是所有幹部的責任。
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